Катализдик активдүүлүктү ишке ашыруу үчүн ферменттердин көбүнө көмөкчү элементтер – кофакторлор керек. Бул заттар протеиндик эмес жана дайыма эле фермент молекуласынын структуралык бөлүгү боло бербейт. Белок менен кофактордун функционалдык комплекси голофермент, ал эми белок бөлүгү гана апофермент деп аталат. Ферменттин туруктуу бөлүгү болгон жана аны менен коваленттик байланыштар менен байланышкан кофактор протездик топ деп аталат.
Кеңири мааниде кофактор – бул кандайдыр бир татаал белоктун кошумча тобу, аны функционалдык абалда кармап турат. Фермент белокторунда кофакторлор катализдик реакцияга түздөн-түз катыша алышат.
Кофакторлордун мүнөздөмөлөрү жана түрлөрү
Кофакторлор химиялык жактан 2 чоң топко бөлүнгөн төмөнкү молекулалуу заттар:
- эки валенттүү металлдардын иондору (цинк, магний,калий, жез, марганец, темир ж.б.);
- коэнзимдер - органикалык белок эмес бирикмелер.
Өз кезегинде коферменттери витаминдерге жана витаминдик эмес мүнөздөгү бирикмелерге бөлүнөт. Акыркысына төмөнкүлөр кирет:
- UDP-глюкоза;
- нуклеотиддер;
- металлопорфириндер;
- FAD, АШЫК+, NADP+;
- глутатион;
- ubiquinone;
- S-аденозилметионин.
Кофакторлор ферменттер менен күчтүү коваленттик жана алсыз байланыштарды түзө алышат. Кээ бир топтор полипептиддик бөлүк менен ушунчалык катуу аракеттенгендиктен, аларды химиялык жактан да бөлүү кыйын.
"Кофактор" жана "кофермент" түшүнүктөрүн аныктоодогу кыйынчылыктар
Тар мааниде кофакторлор металл иондору, коферменттер болсо органикалык табияттагы топтор. Эгерде бул элементтерди функционалдык мааниси жагынан карасак, анда кофактор катализдик реакцияга катышпайт, демек кофермент болуп саналбайт. Жалпыланган чечмелөөдө кофермент кофактордун өзгөчө учуру болуп саналат.
Мындай бир катар интерпретациялар азыркы биохимияда бул терминдер универсалдуу аныктамасы жок эки ача түшүнүктөр экендигине байланыштуу.
Кофакторлордун биологиялык ролу
Фермент кофакторлору ар кандай функцияларды аткара алат, анын ичинде:
- үчүнчү жана төртүнчүлүк конформациялардын пайда болушуна жана турукташуусуна катышуу;
- субстраттын же каталитикалык борбордун турукташтыруу, камсыз кылууалардын ортосундагы толуктоо;
- кошумча субстрат катары катализге катышуу;
- ферменттик активдүүлүктү жөнгө салуу;
- калыбына келтирүү реакцияларына катышуу.
Кофактордун аракет механизмине жана химиялык табиятына карабастан, ал жок болгон учурда фермент каталитикалык активдүүлүктү аткара албайт. Бирок, иштеши кофакторлор менен байланышпаган ферменттердин чакан тобу бар.
